В стационаре для взрослых работает региональный сосудистый центр, отделения кардиологии, неврологии для больных с ОНМК, сердечно-сосудистой хирургии. Хирургический кластер «Коммунарки» представлен отделениями общей, гнойной, нейрохирургии. Открыты отделения травматологии и ортопедии, челюстно-лицевой хирургии, гинекологическое, урологическое. Действует стационар кратковременного пребывания.В амбулаторном корпусе функционируют консультативно-диагностическое отделение, эндоскопический центр, центр амбулаторной онкологической помощи, отделение планового гемодиализа и дневной стационар для проведения химиотерапии. Специализированную медицинскую помощь здесь могут получать сотни тысяч москвичей.

Новый перинатальный центр стал первым акушерским стационаром на новых территориях Москвы. Здесь принимают роды с любыми видами осложнений у пациенток, а реаниматологи и педиатры выхаживают недоношенных новорожденных с низкой и экстремально низкой массой тела.

В 2023 году в ММКЦ "Коммунарка" открылся роботический центр. С использованием робота da Vinci Xi в клинике оказывают помощь по урологическому направлению – в первую очередь, это лечение рака простаты. 

Операции с использованием робота da Vinci проводят врачи, прошедшие специальное обучение и получившие подтверждающий сертификат от компании-производителя робота Intuitive. Всех сертифицированных хирургов клиники вносят в международную базу специалистов, оперирующих на da Vinci.

Клиника работает со всеми страховыми медицинскими организациями в городе Москве, которые относятся к Московскому государственному фонду обязательного медицинского страхования. Услуги оказываются по квоте, а также на платной основе. Записаться на прием в клинику можно по телефону или через форму “Обращение к врачу” (форма находится в верхнем правом углу на странице каждого врача, раздел “Оперирующие хирурги”).